您的樣品是否含有<20 kDa的目標蛋白質？請下載如何使用SDS-PAGE檢測合成肽的方案，其中包括考馬斯藍染色，銀染和電印跡的有效方法。
Tricine-SDS-PAGE常用于分離1-100 kDa質量范圍內的蛋白質。它是用于分辨小于30kDa蛋白質的首選電泳系統。
通過SDS-PAGE看到小肽確實是非常困難的。 Tris-tricine凝膠會給你更好的分辨率。如果您只想檢測肽，質譜仍然是確認肽身份的最佳方法。
     小肽與較大的蛋白質結合較少的考馬斯亮藍色。因此，較小的肽通過考馬斯染色或銀染更難以檢測。如果你真的想在凝膠上看到你的肽，你可以嘗試加載更多的樣品。除非您認為您的肽從凝膠中遷移出來，否則更換凝膠百分比不會有多大幫助。您可以增加常規17％凝膠中交聯劑的百分比。此外，與常規8.8相比，將分辨凝膠的pH值提高到9.5。另外，尿素（4-8M）的添加有助于削尖帶。
如果您要使用西方，這是一種更靈敏的檢測方法，請使用西方，而不是凝膠染色。然而，肽可以簡單地穿過膜。如果你重復實驗，試著把兩片膜片和更短的時間轉移（在200毫安時少于1小時）。 0.2um的毛孔就足夠了。你可以得到更小的毛孔，但這不應該是必要的。您可能需要按設備的建議電流密度（mA / cm2）進行半干轉印15-20分鐘。短的15分鐘轉移時間適用于大多數小肽。
     如果您可以提前計劃并合成用生物素標記的對照小肽，您可以監測轉移過程及其與鏈霉親和素綴合的HRP結合膜的能力。