一是悶棚前用土壤消毒劑處理土壤。在悶棚前先澆一遍大水、透水，隨水灌施液體土壤消毒劑。為了達到更好的效果，澆透水后覆蓋地膜。這樣處理后，土壤中的病菌都會被殺死。
 
　　二是定植前后噴三遍藥。第一遍藥是在定植前，用普力克72.2%、霜霉威鹽酸鹽水劑（800倍液）和適量生根粉浸透穴盤，既防病又促進根系生長。第二遍藥是在定植前噴灑霜霉威鹽酸鹽和農用硫酸鏈霉素，保護椒苗不受病菌浸染。第三遍藥是在甜椒定植后2～3天噴灑一遍銅制劑，防治細菌性病害。

三是澆水后勤劃鋤。甜椒定植后要注意養護根系。秋茬甜椒定植時氣溫較高，水分蒸發量大，要勤澆水，補充甜椒需要的水分。甜椒定植后10天內一般需要澆3次水，每次澆水后注意劃鋤，增加土壤透氣性，促進根系生長發育。

四是莖稈刷生石灰防病害。病菌極易從甜椒莖基部侵入，如疫病、莖基腐病、軟腐病等，這是導致甜椒死苗的主要原因。在甜椒莖稈長到筷子粗時，用生石灰加水調成糊狀，用刷子刷在辣椒莖基部，這樣可以減少甜椒莖基部病害發生。

五是晚覆地膜，促進根系生長。不少菜農在甜椒定植后沒幾天就覆蓋地膜，8月份甜椒定植時，棚內溫度較高，若覆蓋地膜地溫更高，不利于根系生長，根系弱了極易出現死苗現象，應該是在10月中旬開始覆蓋地膜，促進根系深扎。