炭疽病是辣椒上的常發病害，特別是在高溫季節，果實受灼傷，易并發炭疽病，使果實失去商品價值。

炭疽病主要危害辣椒果實和老葉，也可侵染莖部。果實染病，初現水漬狀黃褐色圓斑，擴大后邊緣褐色，中央灰褐色，病斑有隆起的同心輪紋，由許多黑色或橙紅色的小點集成。潮濕時病斑表面溢出紅色黏稠物，被害果內半軟腐，易干縮。葉片染病，產生近圓形褐斑，中間灰褐色，后期產生輪狀排列的黑色小粒點，嚴重時導致落葉。莖和果梗染病，出現不規則短條形凹陷褐斑，干燥時表皮易破裂。

辣椒炭疽病由半知菌亞門真菌侵染引起，病菌以分生孢子附著在種子表面或以菌絲潛伏在種子內越冬，播種帶菌種子會引起幼苗發病。病菌還能以菌絲或分生孢子盤隨病殘體在土壤中越冬，成為下一季的初侵染源。越冬后長出的分生孢子萌發長出芽管，從寄主表皮的傷口侵入，發病后長出大量分生孢子進行再侵染。高溫高濕環境有利于發病，地勢低洼、土質黏重、通透性差、施肥不足或氮肥過多、管理粗放造成傷口、果實受暴曬等，都會加重病情。

防治辣椒炭疽病，應實行綜合防治措施。播前翻曬土壤，減少初浸染源；選用無病種子，用50℃的熱水浸種20分鐘；合理密植，使辣椒封行后行間不郁蔽，果實不暴露；適當增施磷鉀肥；防止田間積水；及時采果；發現病果立即摘除帶出田外銷毀；重病田與瓜類和豆類蔬菜輪作2～3年。發病初期，用50%多菌靈可濕性粉劑或70%代森錳鋅可濕性粉劑500倍液噴霧防治。保護地栽培可以每畝用45%百菌清煙劑250克熏蒸防治。