棒式栽培香菇的菌棒經過秋冬二季出菇，含水量減少。為了使香菇增加產量，需要進行補水處理。補水方法有注水法和浸水法兩種，現主要介紹注水法補水。

菇畦中的菌棒就地不動，用直徑2厘米的塑料管沿著畦向安裝，菇畦中間設總水管，總水管上分支出小水管，小水管長度在50厘米左右，上面安裝12號針頭控制水流。由總水管提供水源，另一端密封。裝水容器高于菌棒2米左右，使水流有一落差的壓力，在注水時菌棒中心用直徑6毫米的鐵棒插孔1個，孔深約菌棒高度的3/4，不能插到底以免注水流失，由于流量受到針頭的控制，滴下的水菌棒即能吸收又不致于溢出，一般15分鐘就能補水完畢。補水后蓋上薄膜，控制溫度在20℃～22℃之間發菌，每天換氣1～2次，每次1小時，注水給菌棒提供了充足的水分，并同時增加了干濕差和溫度差，6天后開始出現菇蕾而且菇潮明顯，子實體分布均勻，當溫度升到23℃以上時原基形成受到抑制，要利用早上低溫時噴冷水降溫，刺激菌棒形成原基再出一批菇，由于溫度的升高再加上菌棒養分也所剩無幾，菌絲衰弱，并且無活力，即可結束菌棒栽培。