食用菌的繁殖方式有無性繁殖和有性繁殖。
    （一）無性繁殖

      無性繁殖是食用菌繁殖的基本方式，即不經過兩性細胞的配合，就能產生新的個體。它的特點是能反復進行，產生個體多。大多數食用菌的無性繁殖是通過無性孢子如節孢子、芽孢子、厚垣孢子等來實現的。這些孢于萌發后能形成新的個體。具體方式有：

    1、節孢子（粉孢子） 是一種薄壁的無性孢子，通常由菌絲斷裂而成，呈短枝狀，每段可長成一個新個體。銀耳菌絲體（不論單核菌絲或雙核菌絲），受到不良環境條件（如熱、浸水、攪動等）的刺激會斷裂成節孢子，待環境條件適宜，節孢子萌發成菌絲。

    2、厚垣孢子 是一種細胞質密集，四周細胞壁增厚的休眠細胞，常形成于菌絲細胞間。如草菇菌絲在老熟時形成的紅色物即厚垣孢子堆。當條件適宜時，厚垣孢子又萌發為菌絲體。

    3、分生孢子 由菌絲的一部分轉變成分生孢子梗，由分生孢子梗生出的孢子叫分生孢子。如毛柄金錢菌的菌絲體能斷裂成單細胞的分生孢子。分生孢子在適宜條件下又能萌發成單核菌絲或雙核菌絲。

    4、芽生孢子（芽孢子） 是從一個細胞以出芽方式形成的無性孢子，又稱酵母狀分生孢子。如銀耳的單核菌絲或雙核菌絲均可產生芽孢子，芽孢子在一定條件下又能萌發成單核菌絲或雙核菌絲。

    （二）有性繁殖

        食用菌的有性繁殖是經過不同性別細胞配合后產生一定形態的有性孢子來實現的。主要經過質配、核配和減數分裂三個階段。質配是兩個細胞的細胞質發生融合的現象；核配是將兩個單倍體核融合為一個雙倍體的合子核；減數分裂把合子核的染色體減半，又重新產生四個單倍體核。

    食用菌是通過形成有性的子囊孢子和擔孢子來實現其有性生殖的。

    1、子囊孢子的形成 子囊孢子是子囊菌的主要特征，發生在子囊細胞內。子囊細胞是由雙核細胞的鉤狀側枝發育成的。雙核菌絲細胞的兩個核融合（核配）成為染色體雙倍的合子核后，經三次細胞分裂，其中一次為減數分裂，染色體減半，結果在一個子囊里形成了八個單倍的核，這些核粒外囊細胞質后，就成了八個子囊孢子。

    2、擔孢子的形成 擔孢子是擔子菌特有的特征，它外生在擔子上。擔子是由雙核菌絲細胞末端（呈棍棒狀）發育成的。棍棒狀的擔子細胞，經核配和二次細胞分裂，其中一次為減數分裂，染色體減半，形成四個單倍體的子核，每個子核分別進入擔子上部所出生的四個小梗，之后四個梗就發育成為四個擔孢子，當擔子內的核進行減數分裂時，性基因發生分離，異宗結合的食用菌，核成兩種或兩種以上的配合型， 由于不同型核分別進入擔孢子，就構成了不同性別的擔孢子。