一、打撈菌核關。紋枯病主要靠菌核在稻田里越冬，越冬的菌核經過冬春到早稻插秧時，一般有60-70%的菌核能發芽。落在田里的菌核數量和發病有一定的關系，上年或上季發病重的田塊，落在田里的菌核都比水輕，在長時間內能隨水漂浮，稻田灌水后，撈除浮在水面上的菌核，能減少初次浸染的菌源，有效地減輕水稻前期發病率。撈除的方法是在田面耙平以后，適當加深水層，然后用畚箕等工具把浮在水面上的浪渣和菌核撈起，挑離稻田，深埋或曬干燒毀。

二、肥水管理關。加強肥水管理，提高秧苗抗病能力。偏遲、偏重施用氮肥、長期灌深水都易造成秧苗莖葉柔軟嫩綠，郁閉嚴重而降低抗病能力，加重紋枯病發生。因此，在施肥策略上要掌握以下三條原則：一是重視基肥，多施農家肥和有機肥，一般基肥用量應占總施肥量的60%。二是氮、磷、鉀三要素合理搭配，特別是氮肥施用量不能過量。三是追肥要早、要適量，要按"前重、中控、后補"的方法追施。氮肥不能追施過遲，以免引起禾苗貪青而導致紋枯病的大發生。在管水上，實行淺、露、擱、活的灌溉方法，解決土壤中的水、氣矛盾。在水稻分蘗階段要實行淺水勤灌，適當露田，以利排毒增氣，促根壯蘗；分蘗末期適時適度擱田，控制無效分蘗，抑制莖葉徒長；進入孕穗期后，應實行活水灌溉；到灌漿結實期則要堅持干干濕濕，促進秧苗生長清秀，無病到老。

三、毒土預防關。采用稻腳青毒預防，能抑制紋菌病菌絲的生長和萌發，而且藥效穩定，殘效期長，施用后能被稻根吸收，也能滲入葉片，具有保護和防治作用。要求在水稻插后15-20天以內施完，備用20%稻腳青250克拌細土25千克，均勻撒入水稻田內，預防效果顯著。據對比調查，用稻腳青撒毒土的秧苗田病蔸率為10%左右，未撒毒土的田塊，病蔸率在50%以上。但使用稻腳青時，一定要在孕穗期以前，禁止在孕穗期或生育后期使用，因為稻腳青有殺雄功能，在孕穗期使用，輕者出現空穗秕谷，重者不能抽穗。尤其是在高溫缺氮和缺鉀時，對水稻產量影響更大。

四、藥劑防治關。水稻紋枯病的發生一般前期發展較慢，后期上升較快。因此，在早稻分蘗盛期應加強田間調查，當遇到高溫高濕天氣，田間病蔸率在30%左右時就應立即用藥防治。藥劑可選用井崗霉素粉劑每畝1千克或井崗霉素水劑0.2千克兌水50千克，并根據發病程度和天氣情況，連噴2-3次。晚稻生育期短，紋枯病從始發到爆發相距時間一般在半月左右。因此，雙晚宜用藥兩次，一般在拔節孕穗期用藥一次，隔7天后再用藥一次。鑒于紋枯病都從病株下部向上延伸，噴藥應著重噴在稻株的中下部，才能收到良好的效果。