鬼傘類雜菌  

    防治措施：（1）盡量選用新鮮培養料，使用前曝曬2天，或用石灰水浸泡原料。

    （2）控制培養料的含氮量，發酵料或發酵栽培時，麥麩或料糠添加量不要超過5%，禽畜類以3%為宜，無論用何種材料栽培，最好二次發酵，這樣可大大減少鬼傘的污染。

    （3）發酵時培養料的含水量控制在70%以內，以保證高溫發酵獲得高質量的堆料。同時，培養料拌料時，調節培養料的PH值至10左右。 

    木霉  防治措施：木霉在4℃—42℃范圍內都能生長，孢子萌發期喜高濕環境，侵害草菇培養基時，初期白色棉絮狀，后期變為綠色，菌種如果被木霉危害，必須報廢，即使輕度感病的菌種也應棄之不惜。木霉至今沒有理想的根治性藥物，常用的殺菌藥，對木霉只是抑制，而不能殺死，加大藥量，只能同時殺死木霉和草茹菌絲。因此，創造適合草菇菌絲生長而不利于木霉繁殖的生態環境，是控制危害的根本措施。一旦發生木霉為害，要立即通風降溫，以抑制木霉的擴展，處于發菌階段的培養料感病以后，可采用注射藥液的方法抑制木霉擴張，常用的藥液有5%的石碳酸、2%的甲醛、1：200倍的50%多菌靈、75%的甲基托布津、PH值為10的石灰水，此外，往污染處撒白灰面，防治效果也很好。 

    菇螨  防治方法：以預防為主，菇房盡可能遠離倉庫、飼料間、禽畜舍等，栽培原料在進行二次發酵，危害嚴重時，菇房在重新鋪料前要用敵敵畏、殺螨醇等殺螨劑500倍液噴霧或熏蒸24小時，一旦發現體小呈扁平或橢圓形、白色或黃色、長有多根剛毛的菇螨時，要立即選用以下方法將蒸騰作用殺死：熏蒸殺螨：用棉球蘸敵敵畏，放在床架底料上面，然后用塑料布覆蓋床面，使用藥物揮發熏蒸毒殺死螨蟲。噴藥殺螨：用菊樂合酯1500倍液或克螨特500倍液噴霧殺螨。 

    菇蠅  防治方法：在菇場四周設排水溝，排除積水，并定期用0.5%敵敵畏噴殺；培養料進行二次發酵，殺死料內幼蟲和卵；用黑燈誘殺。

    菌蚊  防治方法：保持菇房干凈，栽培場所應遠離垃圾堆及腐爛物質，收獲后的舊料應及早清除，嚴重時，出菇前或采菇后噴晶體敵百蟲1000倍液進行防治。