害蟲種類復(fù)雜，單食性和寡食性害蟲相對較多藥用植物有上千種，包括草本、藤本、木本等各類植物，生長年齡有一年生、幾年生甚至幾十年生。因此，中藥材的害蟲種類相當(dāng)復(fù)雜、繁多。由于各種藥用植物含有復(fù)雜的化學(xué)成分，決定了有某些特殊害蟲喜食這些植物或趨向于這些植物上產(chǎn)卵。因此，藥用植物上單食性和寡食性害蟲相對較多，如枸杞
實(shí)蠅、山茱萸蛀果蛾等。它們只食害一種或幾種近緣藥用植物。
  道地藥材和病蟲害的關(guān)系我國藥用植物栽培有歷史形成的主產(chǎn)區(qū)，也有引種栽培的新植區(qū)，在主產(chǎn)區(qū)栽培的藥材稱為道地藥材。由于地方昆蟲區(qū)系決定了道地藥材的害蟲種類，又因主產(chǎn)區(qū)相對種植面積較大、長期栽培，病源蟲源積累較多，致使某些病蟲害發(fā)生嚴(yán)重。如地黃主產(chǎn)河南，當(dāng)?shù)厥敲藁óa(chǎn)區(qū)，因此棉紅蜘蛛為害十分嚴(yán)重；其他新植區(qū)面積較小，棉紅蜘蛛為害較輕。北沙參鉆心蟲在山東發(fā)生嚴(yán)重，引種到河北等地，均未發(fā)現(xiàn)此蟲為害。
  藥用植物鉆蛀性害蟲和地下病蟲害為害嚴(yán)重藥用植物鉆蛀性害蟲和地下害蟲種類多、為害嚴(yán)重，尤其是常常為害藥用部位（花、果、根、莖等），造成對產(chǎn)量的直接威脅。許多重要藥用植物的根、塊根和鱗莖等地下部分，既是藥用植物營養(yǎng)成分積累的部位，又是藥用部位。這些地下部分極易遭受土壤中的病原菌及害蟲的為害，導(dǎo)致藥材品質(zhì)下降甚至死亡。由于地下部分病害發(fā)病原因復(fù)雜，防治十分困難，因而損失慘重，歷來是植物病害中的難點(diǎn)，而這一問題在藥用植物中尤其突出。幾乎所有的以地下部分入藥的藥用植物都存在嚴(yán)重的地下部分病害，其中以真菌病害為主，也有細(xì)菌和線蟲病害。在生產(chǎn)上較為突出的例子如人參銹腐病和根腐病、貝母腐爛病、白術(shù)根腐病、附子白絹病、當(dāng)歸根腐病等。
  無性繁殖材料是病害初侵染的重要來源許多重要的藥用植物采用無性繁殖，如地黃、貝母、元胡等。有些是種子育苗后用種苗擴(kuò)大種植，如人參、當(dāng)歸等。這些種苗不僅用于主產(chǎn)區(qū)，還常被引種到新產(chǎn)區(qū)。由于這些繁殖材料基本都是藥用植物的根、塊根、鱗莖等地下部分，本身常常受到嚴(yán)重的病害侵染，所以它們是病害的重要侵染來源。如牡丹分根栽植時(shí)，不剔除帶有根結(jié)線蟲的根段，致使根結(jié)線蟲病發(fā)生嚴(yán)重。