在土壤中生活的生物群的總稱。亦稱土居生物（edaphone）、土壤動物（也稱地下動物）。菌類、地表藻類加上高等植物的根部等，都是該群落的組成要素。在陸上群落的營養動態中，土壤生物群落通過腐食食物鏈承擔著植物死體、動物排泄物、動物尸體等有機物的分解，還原成無機物的大部分工作。在自然土壤中，絲狀菌的作用量，較之細菌占有壓倒的優勢。土壤動物通過排出的糞塊，形成土壤團粒結構，改善通氣性和保水性，并可使菌體和孢子在地下擴散等等，從而促進微生物的活動。在日本的自然土壤中，大型土壤動物（蚯蚓類、馬陸類，蜘蛛類、蜈蚣類、甲殼類）的數量每1平方米為102，雙翅目幼蟲為103，姬蚓類、蜱螨類、跳蟲類各為104，自由生活的線蟲類則為105—106，細菌類每克表層風干土達106—107，菌類則為105（菌絲總長達1—6公里）的量級。整個土壤生物群落的呼吸量稱為土壤呼吸，是土壤生物活性的指標。
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