瘢痕組織（scar tissue）的形成是肉芽組織逐漸纖維化的過程。此時網狀纖維及膠原纖維越來越多，網狀纖維膠原化，膠原纖維變粗，與此同時纖維母細胞越來越少，少量剩下者轉變為纖維細胞；間質中液體逐漸被吸收，中性粒細胞、巨噬細胞、淋巴細胞和漿細胞先后消失；毛細血管閉合、退化、消失，留下很少的小動脈及小靜脈。這樣,肉芽組織乃轉變成主要由膠原纖維組成的血管稀少的瘢痕組織，肉眼呈白色，質地堅韌。
　　瘢痕形成宣告修復完成，然而瘢痕本身仍在緩慢變化：如常發生玻璃樣變，有的瘢痕則發生瘢痕收縮，這種現象不同于創口的早期收縮，而是瘢痕在后期由于水分的顯著減少所引起的體積變小，有人認為也與肌纖維母細胞持續增生以至瘢痕中有過多的肌纖維母細胞有關。由于瘢痕堅韌又缺乏彈性，加上瘢痕收縮可引起器官變形及功能障礙，如在消化道、泌尿道等腔室器官則引起管腔狹窄，在關節附近則引起運動障礙；一般情況下，瘢痕中的膠原還會逐漸被分解、吸收，以至改建，因此瘢痕會緩慢地變小變軟；但偶爾也有的瘢痕膠原形成過多，成為大而不規則的隆起硬塊，稱為瘢痕疙瘩（keloid），易見于燒傷或反復受異物等刺激的傷口，其發生機制不明，一般認為與體質有關。那些容易出現瘢痕疙瘩的人的體質稱為瘢痕體質。瘢痕疙瘩中的血管周圍常見一些肥大細胞，故有人認為，由于持續局部炎癥及低氧，促進肥大細胞分泌多種生長因子，使肉芽組織過度生長，因而形成瘢痕疙瘩。