非組蛋白是指細胞核中組蛋白以外的酸性蛋白質。非組蛋白不僅包括以DNA作為底物的酶，也包括作用于組蛋白的一些酶, 如組蛋白甲基化酶。此外還包括DNA結合蛋白、組蛋白結合蛋白和調節蛋白。由于非組蛋白常常與DNA或組蛋白結合, 所以在染色質或染色體中也有非組蛋白的存在, 如染色體骨架蛋白。