生化柴油（Biodiesel），又稱脂肪酸甲酯（Fatty Acid Ester）是以植物果實、種子、植物導管乳汁或動物脂肪油、廢棄的食用油等作原料，與醇類（甲醇、乙醇）經交酯化反應（Transesterification reaction）獲得。生物柴油具有許多優點：①原料來源廣泛，可利用各種動、植物油作原料。②生物柴油作為柴油代用品使用時柴油機不需作任何改動或更換零件。③可得到經濟價值較高的副產品甘（Glycerine）以供化工品、醫藥品等市場。④相對于石化柴油，生物柴油貯存、運輸和使用都很安全（不腐蝕溶器，非易燃易爆）；熱值高（一般可達石化燃料油的80%）：可再生性（一年生的能源作物可連年種植收獲，多年生的木本植物可一年種維持數十年的經濟利用期入現實效益高；可在自然狀況下實現生物降解，減少對人類生存環境的污染。生化柴油因其甲酯的運用性質與石化柴油類同，目前最常用的制取方法是將植物油脂與甲醇予以交酯化反應，并使用氫氧化鈉（對油脂重量的1%）或甲醇鈉（Sodium methoxide）做為觸媒，大約混合攪拌反應2小時，即可制得。由于原料不同，生物柴油的生產工藝和標準亦不一樣。