體溫是指機體深部的平均溫度。由于體內各器官的代謝水平不同，它們的溫度略有差別，但不超過1℃。在安靜時，肝代謝最活躍，溫度最高；其次，是心臟和消化腺。在運動時則骨骼肌的溫度最高。循環血液是體內傳遞熱量的重要途徑。由于血液不斷循環，深部各個器官的溫度會經常趨于一致。因此，血液的溫度可以代表重要器官溫度的平均值。
　　臨床上通常用口腔溫度、直腸溫度和腋窩溫度來代表體溫。直腸溫度的正常值為36.9-37.9℃,但易受下肢溫度影響。當下肢冰冷時，由于下肢血液回流至髂靜脈時的血液溫度較低，會降低直腸溫度；口腔溫度（舌下部）平均比口腔溫度低0.3℃，但它易受經口呼吸、進食和喝水等影響；腋窩溫度平均比口腔溫度低0.4℃.但由于腋窩不是密閉體腔，易受環境溫度、出汗和測量姿勢的影響，不易正確測定。
　　此外，食管溫度比直腸溫度約低 0.3℃。食管中央部分的溫度與右心的溫度大致相等，而且體溫調節反應的時間過程與食管溫度變化過程一致。所以，在實驗研究中，食管溫度可以作為深部溫度的一個指標。鼓膜溫度的變動大致與下丘腦溫度的變化成正比，所以在體溫調節生理實驗中常常用鼓膜溫度作為腦組織溫度的指標。