一、菌落形態

• ‌大小‌：菌落覆蓋的范圍，一般描述菌落的直徑即可。以毫米計，一般可分大（>3mm）、中（2~3mm）、小（<2mm）三種。
• ‌形狀‌：菌落的外觀形狀，常用詞匯包括圓形、卵圓形、三角形、形狀不規則等。
• ‌隆起狀態‌：菌落切面的形態，常用詞匯包括隆起、凸起、扁平等。
• ‌邊緣特征‌：菌落周邊的形狀，常用詞匯包括波狀、完整、粉粒狀、嚙齒狀等。

二、菌落顏色和光澤

• ‌顏色‌：包括菌落正反面的顏色，即氣生菌絲和基內菌絲顏色，常用詞匯包括白色、乳白色、紅色、粉色、黑色、無色等。
• ‌光澤度‌：指表面有無光澤，可直接描述為菌落表面有光澤、無光澤、光滑、粗糙等。

三、菌落質地和透明度

• ‌質地‌：菌落的粘性、脆性等，常用詞匯包括蠟狀、干燥、易挑起、粘稠感等。
• ‌透明度‌：描述菌落透光的性質，常用詞匯包括透明、半透明、不透明。

四、特殊菌落特征

• ‌光滑型菌落（S型菌落）‌：新分離的細菌大多呈光滑型菌落，表面光滑、濕潤，邊緣整齊。
• ‌粗糙型菌落（R型菌落）‌：菌落表面粗糙、干燥、呈皺紋或顆粒狀，邊緣大多不整齊。
• ‌黏液型菌落（M型菌落）‌：黏稠、有光，似水珠樣，多見于有厚莢膜或豐富黏液層的細菌。

五、利用鑒別培養基

細菌分解糖類和蛋白質的能力不同及代謝產物的差異，鑒別培養基是通過特定作用底物和指示劑的反應來鑒別細菌。例如：

• ‌大腸桿菌‌：在特定培養基上可能呈現藍色至紫色菌落。
• ‌沙門氏菌‌：在特定培養基上可能呈現亮紅色菌落。
• ‌金黃色葡萄球菌‌：在特定培養基上可能呈現灰黑色至黑色菌落，周圍繞以不透明圈，其外常有一清晰帶。

在實驗室中，區分不同的細菌菌落通常需要結合以上多個方面的特征進行綜合判斷，同時還需要借助顯微鏡觀察、生化試驗以及分子生物學方法等手段進行進一步鑒定。