選擇大棚薄皮甜瓜品種要三看:一看外觀、品質和市場；二看豐產性、適應性和抗逆性；三看對生長環境和管理水平的要求。要根據自己的設施類型、品種特性、管理能力選擇適宜的品種，并搞好品種搭配。目前種植表現較好的品種有兩大系列，一是常規品種，二是雜交品種。常規品種主要有紅城十號、紅城十五號、京香二號、富爾十五、永甜九、永甜十一、永甜十三、勝紅、科密特三號、航天時代、津甜一等，這些品種肉質甜脆、香味濃郁、品質佳、市場好，但不抗重茬。雜交品種主要有風雷、頂甜一、頂甜二、驕雪五、驕雪六、棚抗518、景甜一等，這些品種食用時肉質無脆感、皮略厚、甜度好、香味不濃，但抗重茬，耐貯運，商品性好。