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從春季開始投苗至秋季，歷經四五個月的養殖池塘底質隨養殖時間的延伸而不斷老化，飼料等有機物培育出大量的微生物（包括害蟲和病菌），秋季適溫的天氣再加上質變的環境，池塘往往變成病蟲害繁殖的溫床，直接對魚類形成威脅。秋季早晚溫差較大，池塘水體容易因上下分層而缺氧。池魚規格逐漸長大、單位容量增加，均會造成池塘魚類病害增加。
環境、病原和魚體三因素相互作用產生魚病，切斷三因素相互作用的任何一環節，均可有效預防魚病。
1．改善養殖環境做好生態防病 進入秋季，在池魚未出現發病癥狀之前進行新塘轉換，這是改善養殖環境的最佳方案；若條件限制，也可以把大量老化池水換掉，補充新鮮江河水來保持良好的水質，同時，早晚應多開增氧機，保證充足的溶氧；若已出現發病癥狀或缺少換水條件，則可使用生石灰調水、過氧化鈣增氧和二氧化氯等化學方法處理，還可使用微生態制劑或中草藥制劑改良。總之，須確保魚類有良好的生態環境。
2．增強魚類自身抗病力 秋季，池魚同時面臨上市和越冬的壓力，如沒有足夠的免疫力是很難抵御各種病蟲害入侵的，因此，秋季飼養管理，飼料除營養均衡、科學投喂外，應適當補充維生素Ｃ、Ｂ、Ｅ和微量元素等，還可適量添加保健性中草藥進行病害預防。
3．消滅病原體 以防為主，做好消毒工作。做到定期、定時消毒預防，主要方法包括：嚴格檢疫，盡量避免進種時帶入病原體（包括病毒）；定期和不定期消毒，包括殺蟲、殺菌，盡可能把蟲、菌消滅在萌芽狀態。
