1、腹腔腹水：腹部膨脹的傳染性魚病剖檢大多數可見腹腔腹水，或透明或混作或血紅。如傳染性胰腺壞死病、斑點叉尾鮰病毒病、鮭皰疹病毒病、牙鲆彈狀病毒病、病毒性出血病敗血癥、鱖魚彩虹病毒病，因細菌感染也可引起其腹腔腹水。

　　2、貧血：產生溶血素的細菌感染癥和血液寄生蟲寄生克造成溶血性貧血。出血性疾病可造成出血性貧血。發生出血性貧血的疾病主要是病毒性疾病，包括草魚出血病、虹鱒病毒性敗血癥、鯉春病毒病等。感染吸血性寄生蟲如水蛭，可造成同樣疾病。營養缺乏(如葉酸不足、缺乏鐵質和維生素B12貧血癥)、放射性污染、造血組織壞死、抗造血藥物(如磺胺)的使用可造成發育不全貧血癥。貧血病魚鰓呈蒼白色，脾臟發生腫大，部分或全部內部器官顏色蒼白，有時有腹水。

　　3、內臟器官的白色結節：許多種細菌感染癥在內臟器官形成肉芽腫，多由細菌性感染引起。真菌類的霍氏魚醉菌以及球蟲(艾美球蟲)、粘孢子蟲(如角形蟲)、線蟲絳蟲等感染皆可形成白色結節或包囊。

　　4、內臟器官的淺黃色結節：某些抗酸細菌和液化腸桿菌及微孢子蟲、孢子蟲、復殖吸蟲等可在內臟器官形成黃色結節。肝癌在肝臟也形成黃色結節。

　　5、內臟器官的潮紅結節：線蟲類如胃瘤線蟲、嗜子宮線蟲等可在內臟器官表面或內部形成紅色結節。此外，剖檢是經常咳在魚腹腔中見到呈白色團塊狀的絳蟲幼蟲。

　　6、內臟組織充血或出血：內臟組織充血或出血是細菌感染的普遍癥狀，如嗜水氣單胞菌、殺鮭氣單胞菌、芽孢桿菌等，一般均由細菌性疾病引起。

　　7、內臟器官液化：一般均由細菌性感染引起。

　　8、肝臟的可見病變：

　　(1)肝腫大：細菌感染(如嗜水氣單胞菌、愛德華氏菌)病毒感染、中毒、維生素缺乏、長期處于低溶解氧中、飼喂腐敗的飼料等。

　　(2)白肝：病毒性感染如傳染性胰腺壞死病、鱖魚病毒病以及產生溶血素細菌感染、寄生蟲性貧血癥的病魚肝臟呈白色。

　　(3)淤血肝：大多數細菌感染克造成肝臟局部或全肝淤血，使肝臟呈暗紅色。

　　(4)綠肝：氣單胞菌、假單胞菌感染以及膽道阻塞克使肝臟變成綠色。

　　(5)黃肝：類脂質變性以及細菌感染(如假單胞菌)克使肝臟呈黃色。鞭毛蟲、孢子蟲、感染。

　　(6)花斑肝：傳染性胰腺壞死病、傳染性造血器官壞死病、鯉春病毒癥。和一些細菌感染。真菌感染、重金屬和藻類中毒素等亦可造成肝壞死。

　　(7)肝的黑斑點：某些真菌感染如外瓶霉的感染癥可在魚肝臟形成黑色斑點。

　　9、腸道的可見病變

　　(1)胃膨脹或積水：細菌性感染較為常見，發病魚胃部龐大，剖檢胃壁變薄，胃

　　內充滿液體，該癥狀的出現常與餌料有關。

　　(2)腸胃炎：病毒和細菌感染可造成胃腸發炎、充血、腫脹，后期腸粘膜脫落或壞死腸道內充滿個色液體。細菌感染較為常見，寄生蟲疾病也可引起腸炎。

　　10、鰾的課件病變：病毒、細菌、寄生蟲均可造成鰾發炎、腫脹和積水。

　　11、肌肉組織的可見病變：

　　(1)肌肉中的結節：剖檢病魚是經常咳在肌肉發現各種結節或包囊，如孢子蟲、微孢子蟲等寄生蟲。

　　(2)肌肉組織點狀充血、淤血或瘀斑：病毒性疾病如病毒性出血性敗血癥以及細菌感染如氣單胞菌、。愛德華氏菌等在成肌肉組織點狀充血、淤血克造成肌肉組織大面積充血。

　　(3)肌肉組織中的起泡：遲緩愛德華氏菌可感染多種魚類，在不同患病魚中癥狀不同。斑點叉尾鮰發生此病的癥狀是體側及尾柄肌肉組織糜爛，病灶處因腐爛而充滿氣泡、腫大，并伴有難聞的惡臭，故有氣腫性腐爛病之稱。