用來冬儲的番茄是從秋延后栽培的大棚內采收的綠熟期果實。綠熟期番茄怕低溫，在8℃以下的溫度條件下存放一定時間就會受凍，表面出現水漬狀凹陷斑，果蒂周圍變成淺褐色，濕度大時產生白霉、青霉或黑霉。凍害嚴重時，番茄水分外滲，整個果實呈半透明水漬狀腐敗。

實踐證明，應先將綠熟期番茄果實放在10～14℃條件下緩慢紅熟，然后放在5～7℃條件下儲藏，期間空氣相對濕度保持在85%～90%，濕度過低會造成果實過度失水、果皮皺縮、香味變淡。現將常用的番茄冬季儲藏保鮮方法介紹如下。

陽畦儲藏法 在畦內鋪麥秸或稻草等保溫材料，將綠熟期果實擺在上面，厚度15～20厘米，上蓋塑料薄膜，保持膜內溫度在12～14℃，不能低于10℃，遇連續晴天畦溫升高，可蓋草簾遮陽。隨著果實成熟，隨時挑選上市，或移入5～7℃條件下儲藏。

室內儲藏法 在能夠保持溫度不低于8℃房間內的地面先鋪稻草或麥秸，再鋪一層塑料薄膜，將綠熟期果實擺在膜上，厚20厘米左右，然后用塑料薄膜覆蓋。果實成熟后溫度降至5～7℃。