RefSeq NM_xxxxxx和GenBank Afxxxxxx看起來是重復(fù)的，但RefSeq和GenBank是分開的數(shù)據(jù)庫，而且兩者都是可以通過在Entrez nucleotide中輸入各自的ACCESSION獲得。開始時臨時的RefSeq記錄與GenBank記錄非常相似。但是，當(dāng)RefSeq記錄被專家review以后，新增的序列數(shù)據(jù)、生物學(xué)注解、和參考文獻(xiàn)常被加入。那時，RefSeq條目（即序列）代表一個來自不同實驗室的綜合信息，這時二者可以非常不同。

GenBank是一個多種序列的存儲池，對每個基因都含有許多序列。而RefSeq數(shù)據(jù)庫被設(shè)計成每個人類位點挑出一個代表序列來減少重復(fù)，是NCBI提供的校正的序列數(shù)據(jù)和相關(guān)的信息。數(shù)據(jù)庫包括構(gòu)建的基因組contig、mRNA、蛋白和整個染色體。

RefSeq記錄是有三種可以獲得的狀態(tài)：預(yù)測的，臨時的和檢查過的（reviewd）。檢查過的記錄代表了目前關(guān)于一個基因和它的轉(zhuǎn)錄子的知識的匯編。它們很多都來自于GenBank記錄、人類基因組命名委員會、和OMIM。RefSeq標(biāo)準(zhǔn)為人類基因組的功能注解提供一個基礎(chǔ)。
RefSeq記錄通過以下步驟創(chuàng)建：
1、確定代表不同基因的序列
2、建立正確的基因名字到登錄號的聯(lián)系
3、確定完整范圍的可以獲得的序列數(shù)據(jù)
4、創(chuàng)建一個新的處于三種狀態(tài)之一的參考序列(RefSeq)記錄

為什么RefSeq記錄中的基因符號（symbol）有時和相關(guān)的GenBank中的不一樣？RefSeq全部使用官方基因符號。而GenBank是一個公共的序列備份庫，由數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)者提供。有的作者會向相關(guān)的物種命名委員會取得官方基因符號，但有的作者沒有，所以有時會產(chǎn)生別名。GenBank與Pubmed相同，通過display可以選擇顯示格式，常用的有GenBank和FASTA兩種格式。如果要對基因序列作進(jìn)一步分析，F(xiàn)ASTA格式是很好的選擇。FASTA格式僅包括該序列的簡要特征，并以ATGC4種堿基列出核苷酸序列，簡單明了。而GenBank格式可顯示較完整的基因序列記錄，反映核苷酸序列的詳細(xì)信息。