猴病毒40（SV40）的基因組常用來作為克隆載體，把外源DNA轉入哺乳類細胞。猴病毒40是球形動物病毒，直徑40nm，呈20面體，有一個共價閉環的雙鏈DNA基因組，全長5244bp。它在猴腎中增殖。被SV40感染的細胞都會出現SV40的T抗原。早已證明完整的小鼠染色體β珠蛋白基因（包括所有的間插順序和兩側順序）整合在SV40中后，在被感染的猴腎細胞中都能正確地轉錄和翻譯。表明猴腎細胞的拼接系統能有效地處理小鼠β珠蛋白的初級轉錄本。可是，SV40作為克隆載體有其局限性：①SV40基因組的晚期功能區的裂解性，不利于外源DNA的重組和表達；②早期功能區與病毒的致癌性有關，使用時有顧慮；③重組DNA片段的大小受體限制。