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有機產品認證證書的有效期為一年。證書基本格式由國家認監委統一制定。主要內容應當包括以下幾個方面：
1．獲證單位或個人名稱、地址；
2．獲證產品的數量、產地面積和產品種類；
3．有機產品認證的類別；
4．依據的標準或者技術規范；
5．有機產品認證標志的使用范圍、數量、使用形式或者方式；
6．頒證機構、頒證日期、有效期和負責人簽字；
根據有關規定，認證機構在發放證書時應當告知獲證者有關證書變更、重新申請、證書撤銷、注銷、暫停等規定或事項。
證書變更：獲證者在有機產品認證證書有效期內，發生下列情形之一的，應當向認證機構辦理變更手續：
1．獲證單位或者個人、有機產品生產、加工單位或者個人發生變更的；
2．產品種類變更的；
3．有機產品轉換期滿，需要變更的。
重新申請證書：獲證者在有機產品認證證書有效期內，發生下列情形之一的，應當向有機產品認證機構重新申請認證：
1．產地（基地）、加工場所或者經營活動發生變更的；
2．其他不能持續符合有機產品標準、相關技術規范要求的。
證書撤銷、注銷、暫停的規定：獲證者發生下列情形之一的，認證機構應當及時做出暫停、注銷、撤銷認證證書的決定：
1．獲證產品不能持續符合標準、技術規范要求的；
2．獲證單位或者個人、有機產品生產、加工單位發生變更的；
3．產品種類與證書不相符的；
4．證書超過有效期的；
5．未按規定加施或者使用有機產品標志的。
對于撤銷和注銷的證書，有機產品認證機構應當予以收回。
