(1)實行HACCP可以促進食品質量水平的不斷提高，但對小型食品企業來說進行危害分析采取CCP措施是比較困難的，而我國目前中小型設施的食品企業占多數，因此對于還沒有條件實施HACCP的小型和部分中型食品企業應重點在提高食品工藝水平上下功夫，等待條件許可逐步實施HACCP系統管理。 

(2)衛生監督部門雖然也可運用HACCP系統進行管理，但這種管理方式只有成為企業自身衛生管理的內容時才能顯示出其優越性。 

(3)對同一個關鍵控制點，每個人的觀點會有不同，如一味強調哪個正確是沒有意義的，重要的是是否控制了危害。 

(4)同一種危害的嚴重程度在不同條件下會有不同的判定。如單核細胞增生型李斯特菌，對胎兒、嬰兒、免疫抑制者會造成威脅生命的疾病，而對健康成年人則引起中度或輕微疾病，也就是高敏人群比健康成年人會造成更嚴重的后果。因此在分析一種危害因素的嚴重性時要考慮到工藝和對象等不同條件。 

(5)在實施HACCP中涉及的衛生要求大部分不是法定標準，而衛生要求與國家法定的衛生標準兩者有嚴格的區別，前者具有較大的自由裁量余地，而后者只有遵照執行。雖然《食品衛生法》第九條規定“其他不符合食品衛生標準和衛生要求的”也作為禁止生產經營的食品，但這是指最終產品，而不是指生產過程，因此還必須逐步完善《食品衛生法》第八條的派生性法規，使HACCP成為我國法規建設的一個部分，從法律上將這個管理系統規定下來。 

(6)在HACCP實施中，要以科學為依據，實事求是，扎扎實實地工作，絕不能推論和憑空想象